Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin1P35438 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms