Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms