Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc11P31313 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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