Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms