Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eif3aP23116 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms