Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd3eP22646 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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