Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NefhP19246 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NefhP19246 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NefhP19246 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NefhP19246 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NefhP19246 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NefhP19246 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NefhP19246 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms