Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sptan1P16546 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms