Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms