Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01738 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01738 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01738 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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