Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Copb2O55029 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Copb2O55029 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Copb2O55029 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms