Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BckdkO55028 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms