Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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Ccl25O35903 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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Ccl25O35903 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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Ccl25O35903 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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Ccl25O35903 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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Ccl25O35903 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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Ccl25O35903 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
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Ccl25O35903 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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