Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms