Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp72F8VQC1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms