Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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