Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Crocc2F6XLV1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Crocc2F6XLV1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Crocc2F6XLV1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms