Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BC067074F6RXI4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms