Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms