Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20425E9Q035 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms