Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim12cD3Z3L3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim12cD3Z3L3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms