Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm4950D3YUM8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms