Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms