Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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