Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PtprbB2RU80 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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