Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms