Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Grik3B1AS29 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Grik3B1AS29 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Grik3B1AS29 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Grik3B1AS29 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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