Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CtcflA2APF3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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