Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GabreA2AMW3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms