Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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