Protein–RNA interactions for Protein: V9GXR0

H2-Bl, Histocompatibility 2, blastocyst, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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H2-BlV9GXR0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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H2-BlV9GXR0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-BlV9GXR0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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H2-BlV9GXR0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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H2-BlV9GXR0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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H2-BlV9GXR0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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H2-BlV9GXR0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-BlV9GXR0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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H2-BlV9GXR0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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H2-BlV9GXR0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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H2-BlV9GXR0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-BlV9GXR0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-BlV9GXR0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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H2-BlV9GXR0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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H2-BlV9GXR0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
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