Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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