Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms