Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

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Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpsf3Q9QXK7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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