Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms