Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms