Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup50Q9JIH2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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