Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc4Q9ES56 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms