Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube3bQ9ES34 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube3bQ9ES34 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube3bQ9ES34 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube3bQ9ES34 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube3bQ9ES34 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube3bQ9ES34 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube3bQ9ES34 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube3bQ9ES34 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube3bQ9ES34 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube3bQ9ES34 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube3bQ9ES34 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube3bQ9ES34 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube3bQ9ES34 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube3bQ9ES34 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube3bQ9ES34 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube3bQ9ES34 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube3bQ9ES34 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube3bQ9ES34 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube3bQ9ES34 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms