Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf6Q9DBU5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf6Q9DBU5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf6Q9DBU5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf6Q9DBU5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf6Q9DBU5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf6Q9DBU5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf6Q9DBU5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rnf6Q9DBU5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rnf6Q9DBU5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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