Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ift43Q9DA69 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift43Q9DA69 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms