Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms