Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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