Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms