Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Borcs6Q9D6W8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Borcs6Q9D6W8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Borcs6Q9D6W8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Borcs6Q9D6W8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Borcs6Q9D6W8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs6Q9D6W8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs6Q9D6W8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs6Q9D6W8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs6Q9D6W8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs6Q9D6W8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs6Q9D6W8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs6Q9D6W8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs6Q9D6W8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Borcs6Q9D6W8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Borcs6Q9D6W8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Borcs6Q9D6W8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms