Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syce1Q9D495 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms