Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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