Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ddx28Q9CWT6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ddx28Q9CWT6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ddx28Q9CWT6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ddx28Q9CWT6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ddx28Q9CWT6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ddx28Q9CWT6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ddx28Q9CWT6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ddx28Q9CWT6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ddx28Q9CWT6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ddx28Q9CWT6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ddx28Q9CWT6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ddx28Q9CWT6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ddx28Q9CWT6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ddx28Q9CWT6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ddx28Q9CWT6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ddx28Q9CWT6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ddx28Q9CWT6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ddx28Q9CWT6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ddx28Q9CWT6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ddx28Q9CWT6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ddx28Q9CWT6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ddx28Q9CWT6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ddx28Q9CWT6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ddx28Q9CWT6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ddx28Q9CWT6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ddx28Q9CWT6 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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