Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms