Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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